名偵探柯南：絕海的偵探

薄霧籠罩的京都，一起攸關日本國家安全的大事件即將發生。一艘疑似裝載爆炸物的可疑船隻靠近舞鶴灣。通過對船上相關資料和零部件的勘察判明，該船很大可能來自海外。此訊息一齣，立刻引起全日本上下的恐慌。 就在同一天，江戶川柯南、毛利小五郎、毛利蘭以及少年偵探團的各位一同觀摩海上自衛隊組織的對空作戰演習，他們史無前例地登上了宙斯盾艦穗高號，與全國各地聚集來的孩子們一起，被裝備了電子武裝的高科技宙斯盾艦帶來的巨大魄力所震撼。 誰知演習中突發意外，原本虛擬的作戰瞬間變成真槍實彈的殺戮。不久，海面上漂浮著的失去左臂的自衛隊隊員一等海尉笹浦洋介遺體被發現。種種不安與猜測在小蘭和少年偵探們的心中蔓延。另一方面，海上自衛隊迅速冷靜地穩定事態，但始終不能探明敵人的真實身份和他的目標。就在此時，宙斯盾艦上發現了遇害隊員的左臂，其配戴的手錶指標停止在上午5:30。接二連三的異常事件，迫使大阪府警乘坐直升機趕來，與京都當地的同儕協作展開調查。在此期間，神秘的女性自衛隊員藤井七海也登上了宙斯盾艦。 柯南通過隨身攜帶的追蹤眼鏡、新道具衛星電話手錶等裝備與灰原哀、阿笠博士取得聯絡，此外更得到服部平次和遠山和葉的協助。最強偵探團全方位通力合作，終於發現了這一系列事件背後的始作俑者——現已秘密潛入軍艦內的某國間諜“X”。在此期間，平次和小蘭等人的生命相繼受到威脅。 X到底有何目的？他的真實身份是什麼？自衛隊員的左臂以及藤井七海的背後又隱藏怎樣的秘密？關係到全日本生死存亡的巨大陰謀，此刻正有條不紊地展開。柯南將於與看不見的敵方間諜進行諜報戰，面臨危浪絕海的緊急任務。此次柯南能否再次守護朋友，協助海上自衛隊保護日本民眾免受戰爭的災禍？